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“我們企業提供增值稅應稅服務，適用6%的稅率，調整前可以抵扣16%或10%的進項稅，調整后卻只能抵扣13%或9%的進項稅，是否會增加稅負?”
“如果按不含稅金額作為收付款的基數，對于流通環節的企業，利潤沒有影響，是否實際享受不到減稅的紅利??”
“房地產企業現在收的預收款已預繳了增值稅，實際交房時稅率已調整，那交房時是按10%計提銷項稅、還是按9%計提銷項稅?一般納稅人一般計稅辦法核算的開發產品，銷售時土地價款抵減的增值稅銷項稅額，計算時按取得土地時的稅率10%、還是增值稅應稅收入實現進適用的9%的稅率計算?”
為了排解納稅人的各種疑慮和擔心，我們需要從增值稅基本設計原理來分析。
首先，我們都知道增值稅是流轉稅，是對業務流轉過程中增值額征收的稅種。但在實施中為了便于操作，執行抵扣的制度，即以銷項稅額減去進項稅額計算應交的增值稅。
另外一個很重要的特點是增值稅屬于價外稅。
結合以上增值稅基本特點，企業銷售貨物的銷項稅額是企業在銷售貨物時，與貨物價款一起向購買方收取的稅款。也就是說，您公司以116元賣了貨物，向客戶收取的116元是由兩部分組成：一部分是貨款100元，另一部分是16元的稅款;如果稅率從16%降到了13%，那您公司銷售時向客戶收取的款項就是100元的貨款和13元的稅款。購買方如果是終端消費者，那么稅款就是降了3元。如果購買方是處于流轉環節的中間企業，那么他支付116元時，他可以抵16元，是因為他付款的金額中就包含16元的稅款;如果稅率降低后，流轉環節的購買方支付的價款是100元的貨款和13元的稅款，所以，可以抵扣的稅款是13元。
所以，提供增值稅應稅服務，適用6%的稅率，調整前可以抵扣16%或10%的進項稅，調整后卻只能抵扣13%或9%的進項稅，是因為稅率調整后，采購時支付價款時包含的稅款就是按13%或9%算出的金額，因為支付的少了，所以抵扣的少了。稅率調整后，企業并沒有少抵扣進項稅，倒是在支付貨款的時候就少付了，則不是等銷售貨物后抵減應納稅額，使企業可控制的現金增多。
按照上面分析，稅率調整前、后，企業銷售貨物時收的貨款不變(都是100元，只是稅款部分由16元變成了13元)，采購的成本也沒有變化，稅率的調整對企業利潤就沒有影響，降稅率對企業有什么意義?
前面說到增值稅是對貨物流轉過程中增值額征收的稅。企業銷售收入與采購成本沒有改變的情況下，該產品的增值額就沒有變化，但適用稅率降低，那么企業增值稅稅額會減少，增值稅稅負就會降低。所以增值稅稅率降低后，流通環節的企業交的增值稅還是會減少。只是因為增值稅是價外稅，所以不會影響到利潤(不考慮增值稅附加稅費)。
最后，增值稅計提時適用的稅率應當是增值稅納稅義務發生時的有效稅率。所以，房地產企業銷售開發產品收到預收款時沒有發生納稅義務，只是預繳增值稅;等交付房產實際發生了納稅義務時適用的增值稅稅率已調整為9%的，則計算銷售開發產品的銷項稅額適用的稅率應當為9%。而一般納稅人銷售開發產品適用一般計稅辦法時，計算銷項稅額時，可以扣除土地價款后計算，計算公式為(收取的全部價款-可扣除的土地價款)/(1+適用稅率)*適用稅率，所以稅率調整后，土地價款計算的銷項稅額抵減是按納稅義務發生時適用的稅率計算，而不是取得土地時適用的稅率計算。本質上與抵扣進項稅額還是不一樣的。
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